Temporada 1

Cuando raptan a una niña blanca de 8 años a plena luz del día en Ohio, el equipo se dirige hacia allí para intentar ayudar a la Policía local a buscar a la pequeña usando un perfil del sujeto. Una mujer afroamericana les revela que también secuestraron a su hija de 8 años unos días antes. Durante la investigación, el equipo descubre que otras dos niñas afroamericanas fueron secuestradas y asesinadas, y el equipo se da cuenta de que el sujeto es más complejo de lo que parecía.

Una mujer está matando a hombres en hoteles de lujo y haciendo más lenta su agonía para verlos morir. La conducta es inusual para una asesina en serie, y el equipo sospecha que está siendo manipulada por algún hombre. La investigación los lleva hasta Marcus, un asesino preso que está seguro de que el FBI nunca encontrará a la asesina.

Asesinan a un hombre en un aparcamiento de Tucson y la asesina se lleva sus ojos. Mientras el equipo intenta hacer el perfil del agresor, los ojos aparecen sobre un periódico. Cooper y su equipo intentan interpretar los mensajes, pero una inspectora de la Policía local hace declaraciones públicas que provocan a la asesina.

Cooper y su equipo viajan a Chicago, donde un francotirador está matando a gente al azar en la calle. Cuando investigan el lugar del crimen, el francotirador los observa a distancia, identifica a Mick como un tirador de élite y le envía un localizador para poder avisarlo de cuándo va a volver a matar. Cuando García finalmente identifica al asesino, el equipo se apresura a detenerlo y evitar así una masacre.

Una bomba estalla en un instituto y las pistas llevan hasta un padre de tres hijos cuya esposa murió dando a luz al cuarto. Su tragedia lo lleva a creer que necesita matar a sus hijos y a otros jóvenes para que no tengan que sufrir.

El equipo del FBI trabaja para hacer el perfil de un asesino que está matando a personas a lo largo de una autopista. Elige a las víctimas al azar y la Policía local no da abasto para vigilar toda la autopista y vías secundarias. El equipo de Cooper sospecha que el asesino tiene secuestrada a una persona a la que obliga a presenciar los crímenes, pero la situación es aún más sórdida de lo que imaginaban y se ven obligados a rehacer el perfil del asesino.

Un joven intenta detener un secuestro a la salida de una discoteca y acaba degollado. Cooper se siente motivado por el valor que ha demostrado el joven y busca salvar a la joven desconocida que ha sido secuestrada. Para ello trabaja codo con codo con la Policía local e investiga secuestros similares. Cuando el equipo intenta identificar a la última víctima y localizar al sujeto, un horrible hallazgo revela lo psicópata que es el asesino.

Hay un asesino en serie que ha matado brutalmente a varios jóvenes en el espacio de unas horas. El equipo de Cooper hace el perfil del asesino y se dan cuenta de que se está volviendo cada vez más agresivo y que sus víctimas solo sustituyen al verdadero objeto de su ira.

Cooper y su equipo viajan a New Hampshire, donde han desaparecido tres madres jóvenes dejando abandonados a sus bebés en el lugar del secuestro. Mientras hacen el perfil del asesino, que parece brutal en los asesinatos pero arrepentido por cómo abandona los cadáveres, se dan cuenta de que están buscando a dos sospechosos: uno que mata a las víctimas y otro que limpia el escenario del crimen.

El director Fickler le pide a Cooper que vaya a Los Ángeles para testificar sobre las técnicas utilizadas para hacer los perfiles y evitar que una asesina convicta salga de la cárcel. Pero cuando amenazan al fiscal asignado al caso, Cooper pide ayuda a su equipo. Mientras, Beth se queda al mando del equipo para que Cooper pueda centrarse en el juicio, pero acaba teniendo problemas para ejercer el liderazgo.

Cuando secuestran a la ahijada del director Fickler y a una amiga suya, llama a Cooper y a su equipo para que investiguen el caso. Aunque Fickler sospecha que es un secuestro para pedir un rescate, el equipo se da cuenta de que la amiga ha sido cómplice del rapto y encuentran pruebas de que en realidad se trata de un asesino en serie. No obstante, el sospechoso no encaja en el perfil habitual e intentan descubrir el misterio de su personalidad antes de que se le acabe el tiempo a Emma.

Aparece un marine muerto en Quantico con la mitad de la cara cortada, y Cooper y su equipo acuden a investigar la agresión. Mientras el grupo trabaja en el perfil del sujeto, aparecen más detalles sobre estas horribles agresiones. Cuando el sujeto secuestra a una adolescente, los agentes del FBI deben apresurarse en identificar y detener al asesino.

Cooper y su equipo se desplazan a Texas para investigar unos insólitos asesinatos. Disparan a la gente a plena luz del día y luego dejan el arma en el lugar del crimen. El equipo descubre que un perturbado está manipulando a la gente que comete los asesinatos. Este sujeto secuestra a sus seres queridos y los amenaza. Mientras los agentes intentan averiguar quién se esconde tras estos asesinatos, Beth y el Profeta caen en una trampa y acaban secuestrándola. Los agentes se apresuran para encontrar a Beth. Mientras tanto, Cooper se pregunta si las personas en el fondo son buenas o no.