Temporada 1

Cuando transfieren a su escuela a dos estudiantes misteriosos, Lisa pelea en su clase y en la casa y se enreda en un ataque terrorista.

Lisa descubre que su padre ha abandonado la familia. Nueve y Doce trabajan en una bomba de teléfono celular y emiten una nueva amenaza. Kurahashi confía en Shibazaki.

Shibazaki se transfiere a la agencia para dirigir la investigación. Shibazaki sigue una pista acerca del robo de plutonio y lanza un desafío público.

Si Shibazaki logra resolver un acertijo, puede evitar que explote una bomba, pero solo si todos siguen las reglas.

Nueve y Doce discuten sobre darle refugio a Lisa. Shibazaki encuentra un vínculo entre todos los bombardeos, pero ¿podrá evitar que un tren vuele en pedazos?

El jefe trae al FBI. Lisa se siente impresionada al ver los resultados de su trabajo. Cinco traza una estrategia, usando el aeropuerto como un tablero de ajedrez.

Shibazaki y los oficiales descubren evidencia incriminatoria que los conduce de nuevo a la policía. Shibizaki debe rescatar a los pasajeros de un avión con una bomba.

El frustrado bombazo se le atribuye a Sphinx. Suspenden definitivamente a Shibazaki. Lisa corre para salvar su vida. Shibazaki profundiza en el Proyecto Athena.

Kokonoe corre para efectuar un último ataque y Hisami lucha para salvar a Lisa. Shibazaki expone casi todas las partes del Plan Athena.

Se acumula la presión cuando Nueve y Doce deciden separarse y Shibazaki tiene una reunión con Mamiya, la mente maestra del Plan Athena.

Japón se inunda de pánico cuando evacuan Tokio y detonan un dispositivo nuclear de gran altura. El proyecto Athena termina en tragedia.