Temporada 6

Un asesinato conduce al 5.0 a investigar una historia de piratas de siglos de antigüedad que implica un tesoro enterrado, y parece que el asesino está utilizando una pintura robada como un mapa del tesoro. Además, la mañana después de su boda, Kono y Adam son secuestrados y torturados por Gabriel, y Danny muestra preocupación por McGarrett sobre la vuelta de Catherine a la isla.

El 5.0 investiga cuando una brigada de artificieros es atacada y el culpable amenaza con detonar artefactos explosivos ocultos adicionales a menos que el pirómano Jason Sinclair sea liberado de la cárcel. Además, después de que Adam regrese del hospital, Kono se da cuenta de que están siendo observados y McGarrett se prepara para llevar su relación con Catherine al siguiente nivel.

Mientras el 5.0 investiga la muerte de un buzo con un arma usada recientemente en otro asesinato, McGarrett se prepara para proponer matrimonio a Catherine.

El 5.0 investiga cuando un recluso rico es encontrado muerto en un campo remoto con casi un millón de dólares en billetes falsos. Además, Adam es secuestrado por la Yakuza y obligado a torturar a uno de los hombres de Gabriel.

El 5.0 debe interrogar a miembros de una banda motoristas acrobáticos para encontrar a un asesino que escapó saltando con su motocicleta de un techo a otro. Además, el equipo se prepara para competir en un concurso de Tough Mudder.

Es Halloween en Oahu, y el 5.0 debe localizar a un asesino en serie inspirado en Frankenstein. Además, Jerry pide ayuda al 5.0 ayuda cuando una banda armada asalta un banco de sangre, y Danny debe localizar a Grace que le mintió y se coló a una fiesta de Halloween.

La primera cita de McGarrett con Lynn (Sarah Carter) en una isla desierta se vuelve mortal cuando un jefe de la mafia escondido allí les persigue con el fin de mantener su ubicación en secreto. También, Chin, Kono y Grover deben correr contra el reloj del partido para localizar al padre de una estrella de fútbol del instituto que será asesinado por un apostador local, si su hijo no pierde el partido.

El 5.0 trabaja con un estafador para encontrar a un asesino. La inspectora de la policía de San Francisco Abby Dunn ayuda a Chin Ho a investigar el asesinato de de unos traficantes de armas chinos. Adam se reúne con el jefe de la Yakuza

Después de que un profesor de la universidad sea asesinado, Danny se hace pasar por su sustituto y Eric por un estudiante universitario. McGarrett da consejos a un joven después de que su padre salga de la cárcel y quiera volver a su vida.

El hermano de un boxeador local es asesinado la noche antes de su pelea por el campeonato, y el equipo del 5.0 lo conecta con Gabriel Waincroft, que tiene un objetivo aún más grande en mente. Mientras tanto, Adam se prepara para cumplir su sentencia.

Chin Ho pide a Kamekona que se infiltre para ayudar a resolver el asesinato de un ex socio de tráfico de drogas de su pasado, mientras que Steve y Danny van a un retiro de parejas para trabajar en su relación.

El equipo descubre un misterio sobre espionaje japonés de la Segunda Guerra Mundial después de que un muchacho joven reciba un disparo en un búnker olvidado hace mucho tiempo. Mientras tanto, la tía Deb regresa a Hawaii para visitar a los McGarrett y así poder ayudar a terminar la lista de cosas pendientes de su marido recientemente fallecido.

Grover viaja a Chicago para conseguir una confesión de su viejo amigo Clay Maxwell, sobre el asesinato de su propia esposa. Mientras tanto, Chin y Kono tropiezan accidentalmente con dos asesinos, que los sostienen a punta de pistola sin tener idea que ellos son policías. 

Mientras el 5.0 investiga un doble homicidio que involucra una  infidelidad marital, McGarrett y el equipo recuerdan sus desastrosas  experiencias con el día de San Valentín.

Danny se entera de que el FBI quiere hablar con su madre acerca de la muerte de su hermano. Entretanto, McGarrett se asocia con un joven con autismo que posee información que podría solucionar el asesinato de su único amigo.

Cuando un informante confidencial del 5.0 es acusado de homicidio, McGarrett le pide a su viejo amigo Odell Martin que asista en su defensa.

McGarrett y el 5.0 deben perseguir a una espía rusa que ha robado un pen drive con información clasificada de la Agencia de Seguridad Nacional, que pone en riesgo la vida de un miembro de su familia. Además, McGarrett finalmente sabe por qué Catherine lo dejó, y Abby sigue ocultando a Chin y al equipo su verdadera misión.

Cuando un hombre es encontrado dado por muerto a la deriva frente a la costa de Oahu, el 5.0 descubre una trama mortal de tráfico de esclavos operando a bordo de un barco pesquero ilegal. Además, mientras Danny está fuera con sus hijos, su coche es robado por lo que se apodera de un autobús para perseguir a los ladrones.

Un caso de hace 25 años fuerza a Grover a huir con su familia cuando un peligroso jefe de la mafia los persigue buscando venganza.

El equipo descubre que el prototipo de una armadura de alta tecnología ha sido robado. Mientras tanto, Jerry trata de ayudar a su hermana a salvar un elefante en cautividad. 

El 5.0 inicia una cacería humana cuando un derrame químico permite que seis peligrosos convictos escapen de prisión, incluido el marido de Kono, Adam.

El 5.0 trata de rescatar a una estudiante universitaria secuestrada de las manos de un peligroso acosador. Mientras tanto, Max, Kamekona y Flippa luchan para sobrevivir tras haber naufragado.

Cuando una mujer aparece asesinada en su propio hogar, el 5.0 descubre que alguien del equipo tiene una profunda conexión con la hija menor de la víctima.

Atrapados dentro de un edificio en ruinas en el barrio chino de Oahu, el 5.0 debe proteger a un Gabriel Waincroft herido y planificar su escape cuando enemigos armados irrumpen en el edificio para matarlo y a cualquiera que se interponga en su camino.

En un intento de contrarrestar una operación de metanfetamina en Hawai, McGarrett y Danny van encubiertos como pilotos traficantes, pero cuando McGarrett es gravemente herido Danny se ve obligado a romper su tapadera y aterrizar el avión con el fin de salvar la vida de su compañero.